其后攻南京、扫捻军，皆如履深渊。这么多年以来，辛苦争战收回的土地，由尺寸之大扩展到几百里，深深恐惧一日之间溃败，前功尽弃。时间紧迫事态危急，军情反复无常，各种不同的意见都产生了：有的说南京的兵进得太早，必然导致军队疲劳、粮草缺乏；有的说应该撤掉围困南京的军队，以使各路援救南京的敌军退去。
曾国藩在这种言论众说不一的时候，用三军不可夺其志，枕着兵器卧在柴草上，坚忍卓绝，最后才能以少胜多，从死亡中逃出来。等到战局已定，对幕僚朋友说：“古人有句话说：忧虑能伤人，我这才几个月，心胆都碎了！幸好有赖国家的鸿福，才得以不死，然而如果今天一病不起，大概是我的精力已经为这事耗尽了。”
何桂清认为，曾国藩取得胜利的战绩不可胜数，惟独那几年坎坷艰辛。当成功与失败交替的时候，孤注一掷以奋争；当危难疑惑动摇的时候，每次都是百折不挠，这是他的意志不以生死而变化和具有过人坚忍的结果。
何桂清还把曾国藩与以往历史上相似人物的文治武功做了比较，说唐代的李光弼、郭子仪，也仅仅收复了两京；宋代韩、范，也仅归复西夏一方而已。何桂清认为，清朝武功的强盛，超过前代，多次平定大的战乱，然而像嘉庆年间川楚之战，遭战乱蹂躏的也不过4个省。康熙年间的三藩之战，遭战争蹂躏的尚且只有12个省，而如今的捻军，涉及范围竟达到17个省，朝廷用兵征讨已满20年。若单靠湘、楚军队与他们角逐，而没有淮军在这期间兴起，又怎么能做到南北分兵，接着平定祸乱呢？这是曾国藩有远大韬略，推荐贤才分担劳苦，和衷共济才有后来之功效。